La endogamia como causa de consanguinidad y su asociación con anomalías congénitas / Endogamy as a cause of consanguinity and its association with congenital anomalies

El papel de la endogamia como causa de homocigosidad en la salud humana es un foco de interés en genética médica, debido a su relación con anomalías congénitas y patologías genéticas recesivas. Es un tema importante a pesar de que las tasas de uniones consanguíneas en ciertas sociedades han disminuido con el tiempo; sin embargo, en algunas comunidades se han mantenido estables o han aumentado. La consanguinidad es practicada hasta en el 10% de la población mundial, y los motivos más comúnmente citados son socioculturales y socioeconómicos. Aunque se ha visto una disminución de esta práctica, probablemente por la migración urbana y el aumento de las tasas de educación, la consanguinidad continúa practicándose en todo el mundo. Los efectos más significativos sobre los resultados reproductivos se deben, principalmente, a condiciones hereditarias autosómicas recesivas, que también aumentan la frecuencia de algunos desórdenes médicos. El objetivo de esta revisión es dar a conocer la epidemiología y los factores predisponentes de la consanguinidad, así como presentar la evidencia actual de la asociación entre la consanguinidad originada en la endogamia y las anormalidades congénitas y patologías médicas como consecuencia de trastornos genéticos mendelianos. Se requiere un enfoque culturalmente apropiado para el asesoramiento genético en relación con la endogamia

The role of consanguinity as a cause of homozygosity in human health is a focus of interest in medical genetics, due to its relationship with congenital anomalies and recessive genetic pathologies. This is an important issue since the rates of consanguineous unions in certain societies have decreased over time, but have remained stable or have increased in others. Consanguinity is practiced in up to 10% of the world population, and the most common reasons are sociocultural and socioeconomic factors. Although there has been a decrease in this practice, probably due to urban migration and an increase in education rates, consanguinity continues to be practiced throughout the world. The most significant effects on reproductive outcomes are mainly due to autosomal recessive hereditary conditions, that also increase the frequency of medical disorders. The aim of this review is to present the current evidence of the association between consanguinity originating from endogamy, with congenital abnormalities and medical disorders originated from mendelian genetic pathologies. A cultural appropriate approach is required for genetic counseling in relation to consanguineous endogamy

Estimation of genetic variation in closely related cycad species in Ceratozamia (Zamiaceae: Cycadales) using rapds markers / Variación genética en especies de cícadas estrechamente relacionadas en Ceratozamia (Zamiaceae: Cycadales) mediante el uso de RAPDs

AbstractThe Ceratozamianorstogii complex from Southern Mexico is made up of four closely related taxa and occurs in similar habitats (Quercus forest). All have linear-lanceolate leaflets with great similarity between them, especially in juvenile stages, but differentiate with age. There has been debate regarding delimitation of species due to character loss in herbarium specimens. The aim of this study was to determine the genetic variation, and to measure genetic similarity between the four taxa. We studied populations in Cintalapa (Chiapas) for C. alvarezii and C. norstogii; the Sierra Atravesada (Oaxaca) for C. chimalapensis, and Villa Flores (Chiapas) for C. mirandae. One population for each taxon was sampled (only one population is known for C. alvarezii) 11-15 randomly chosen adult individuals were sampled. Twenty-eight primers were tested of which five were polymorphic using the RAPD'S technique. The data were analyzed using Bayesian methods. Results revealed low genetic diversity, and a differentiation was found between species, suggesting a recent divergence. A previous morphological and anatomical study on the complex has found the taxa to be distinct. However, the results of this study have shown that the C. norstogii species complex is in a divergence process, probably through genetic drift and founder effects. Rev. Biol. Trop. 65 (1): 305-319. Epub 2017 March 01.

ResumenLos cuatro taxa que componen el complejo Ceratozamia norstogii de especies en el sur de México están estrechamente relacionados y se dan en hábitats similares (bosque de Quercus). Todos tienen folíolos linear-lanceolados con gran similitud entre ellos, sobre todo en las etapas juveniles, pero se diferencian con la edad. Ha habido un debate en relación con la delimitación de especies debido a la pérdida de caracteres en especímenes de herbario. Los objetivos de este estudio son determinar la variación genética y medir la similitud genética entre los cuatro taxones en el complejo. Las poblaciones estudiadas están en; Cintalapa, Chiapas para C. alvarezii y C. norstogii, la Sierra Atravesada, Oaxaca para C. chimalapensis y Villa Flores, Chiapas para C. mirandae. Se tomaron muestras de una población de cada taxón (sólo una población es conocida para C. alvarezii) 11-15 individuos adultos elegidos al azar fueron muestreados. Veintiocho primers fueron probados, de los cuales cinco fueron polimórficos mediante la técnica RAPD's. Los datos fueron analizados utilizando métodos bayesianos. Los resultados revelaron baja diversidad genética y la diferenciación encontrada entre las especies sugiere una divergencia reciente. Un estudio morfológico y anatómico anterior en el complejo encontró que los taxa son distintos. Sin embargo, los resultados del presente estudio han demostrado que el complejo C. norstogii aun se encuentra en un proceso de divergencia, probablemente a través de deriva genética y efectos de fundador.

Charcot Marie Tooth disease (CMT4A) due to GDAP1 mutation: report of a colombian family / Enfermedad de Charcot Marie Tooth (CMT4A) por mutacion en el gen GDAP1: reporte de una familia colombiana

Background: Mutations of GDAP1 gene cause autosomal dominant and autosomal recessive Charcot-Marie-Tooth disease and more than 40 different mutations have been reported. The recessive Q163X mutation has been described in patients of Spanish ancestry, and a founder mutation in South American patients, originating in Spain has been demonstrated. Objective: We describe physical and histological features, and the molecular impact of mutation Q163X in a Colombian family. Methods: We report two female patients, daughters of consanguineous parents, with onset of symptoms within the first two years of life, developing severe functional impairment, without evidence of dysmorphic features, hoarseness or diaphragmatic paralysis. Electrophysiology tests showed a sensory and motor neuropathy with axonal pattern. Sequencing of GDAP1 gene was requested and the study identified a homozygous point mutation (c.487 C>T) in exon 4, resulting in a premature stop codon (p.Q163X). This result confirms the diagnosis of Charcot-Marie-Tooth disease, type 4A. Results: The patients were referred to Physical Medicine and Rehabilitation service, in order to be evaluated for ambulation assistance. They have been followed by Pulmonology service, for pulmonary function assessment and diaphragmatic paralysis evaluation. Genetic counseling was offered. The study of the genealogy of the patient, phenotypic features, and electrophysiological findings must be included as valuable tools in the clinical approach of the patient with Charcot-Marie-Tooth disease, in order to define a causative mutation. In patients of South American origin, the presence of GDAP1 gene mutations should be considered, especially the Q163X mutation, as the cause of CMT4A disease.

Antecedentes: Las mutaciones del gen GDAP1 son causantes de la enfermedad de Charcot Marie Tooth tanto autosómica dominante como recesiva, y se han reportado más de 40 mutaciones distintas. La mutación recesiva Q163X ha sido descrita en pacientes de ascendencia española y se ha demostrado una mutación fundadora originaria de España en pacientes de origen suramericano. Describimos las características físicas e histológicas y el impacto molecular de la mutación Q163X en una familia colombiana. Objetivo: Se describe el impacto de la mutación Q163X en las características físicas, histológicas y moleculares en una familia colombiana. Métodos: Se describe dos pacientes de sexo femenino, hijas de padres consanguíneos, quienes presentaron inicio de síntomas en los dos primeros años de vida, mostrando deterioro funcional severo, sin evidencia de dismorfía, disfonía o parálisis diafragmática. Los estudios de electrofisiología mostraron una neuropatía sensitiva y motora con patrón axonal. Se solicitó la secuenciación del gen GDAP1, y el estudio identificó una mutación homocigota puntual (c. 487 C>T) en el exón 4, causando un codón de parada prematuro (p. Q163X). Este resultado confirma el diagnóstico de Enfermedad de Charcot Marie Tooth, tipo 4A (recesiva, tipo axonal). Resultados: Las pacientes fueron remitidas al servicio de Fisiatría para evaluación de métodos de asistencia para deambulación. Ellas reciben seguimiento por el servicio de Neumología, quienes vigilan la función pulmonar y el desarrollo de parálisis diafragmática. Se brindó asesoramiento genético. La genealogía del paciente, las características fenotípicas y los hallazgos en los estudios electrofisiológicos son herramientas valiosas en el enfoque clínico del paciente con CMT, de forma que se pueda plantear una posible mutación causal. Se debe considerar la presencia de mutaciones en el gen GDAP1 en pacientes de origen suramericano, en especial la mutación Q163X, como causa de CMT4A.

GENETIC STATUS, SOURCE AND ESTABLISHMENT RISK OF THE GIANT TIGER SHRIMP (PENAEIDAE: Penaeus monodon), AN INVASIVE SPECIES IN COLOMBIAN CARIBBEAN WATERS / Estado genético, origen y riesgo de establecimiento del camarón tigre gigante (Penaeidae: Penaeus monodon), una especie inavasora en aguas del Caribe colombiano

The tiger shrimp (Penaeus monodon) is an Indo-Pacific species. Its global production between 1970 and 1980 exceeded all other shrimp species, which favored its introduction and cultivation outside its natural range in several countries of Africa, Europe, USA and South America. It is currently found in the coast of the Atlantic Ocean (Mexico, United States, Puerto Rico, Brazil, Guyana, Venezuela and Colombia). Despite the risk involved, no studies have been conducted to evaluate their impact as a possible invasive species and their genetic condition. This study evaluated the genetic status and population origin of P. monodon in the northernmost Colombian Caribbean, analyzing the mitochondrial DNA control region (mtDNA-CR). 16 individuals were randomly collected from Golfo de Salamanca and 342 original Indo-Pacific sequences were obtained from GenBank. Parameters of genetic diversity and genetic relationships were analyzed. These results were a total of 358 sequences compared and 303 haplotypes identified. Three haplotypes were identified in the Colombian population. This results showed lower genetic diversity compared with Indo-Pacific populations. These haplotypes were closely related to those found in samples from the Philippines and Taiwan. We discuss the need to create a regional network to characterize the established populations in the Great Caribbean, with the purpose of inferring colonization processes and the establishment of management measures.

El camarón tigre (Penaeus monodon) es una especie del Indo-Pacífico. Su producción mundial entre 1970 y 1980 superó todas las otras especies de camarón, lo que favoreció su introducción y cultivo fuera del área de distribución natural en varios países de África, Europa, EE.UU. y América del Sur. Actualmente se encuentra en la costa del Océano Atlántico (México, Estados Unidos, Puerto Rico, Brasil, Guyana, Venezuela y Colombia). A pesar del riesgo que implica, no se han realizado estudios para evaluar su impacto como posible especie invasora y su condición genética. Este estudio evaluó el estado genético y el origen de la población de P. monodon en el norte del Caribe colombiano, analizando la región control del ADN mitocondrial (ADNmt-CR). 16 individuos fueron recolectados al azar del Golfo de Salamanca y 342 secuencias originales de muestras del Indo- Pacífico fueron obtenidas de GenBank. Se analizaron los parámetros de diversidad genética y las relaciones genéticas. Se analizaron un total de 358 secuencias y se identificaron 303 haplotipos. En la población de Colombia se identificaron tres haplotipos, mostrando una baja diversidad genética en comparación con las poblaciones del Indo-Pacífico. Estos haplotipos se encontraron cercanamente relacionados con secuencias obtenidas de muestras de Filipinas y Taiwán, principalmente. Se discute la necesidad de crear una red regional para caracterizar las poblaciones establecidas en el Gran Caribe, con el propósito de inferir los procesos de colonización y el establecimiento de medidas de manejo.